长期以来，广西壮族自治区党委、政府高度重视全区水运建设，特别是把北部湾港口建设列为加快经济国际化进程，实现沿江沿海区域经济率先发展目标的重要战略支撑。从2004年以来，自治区党委、政府出台一系列政策措施，加大沿海港口建设，促进港口转型升级。随着基础设施的不断完善，广西北部湾港口的综合竞争力不断提高，成为我国中南西南物资出海的重要通道及中国对接东盟国家最便捷的海上门户。2015年，广西北部湾港建成生产性泊位256个，其中万吨级以上泊位79个，分别比“十一五”末增加39个、30个；港口综合通过能力达到2.2亿吨，集装箱通过能力423万标箱，分别是“十一五”末的1.8倍和3.3倍。
2016年1月7日，广西壮族自治区交通运输厅在钦州港与钦州市政府正式签署《实施沿海港口管理体制改革框架协议》。该协议的签署，标志着广西北部湾港三港整合后，真正意义上开启统一规划、统一建设、统一管理、统一运营的“四统一”管理模式。同日，自治区北部湾港口管理局钦州分局正式挂牌成立。
据悉，《协议》确定钦州市港口管理局、钦州市港口调度中心上收并整合并入自治区北部湾港口管理局，钦州港引航站成建制上收自治区北部湾港口管理局管理，钦州市政府承担的港口行政管理职责调整由自治区北部湾港口管理局承担。
1月13日，广西壮族自治区交通运输厅和防城港市政府签署《实施沿海港口管理体制改革框架协议》。《协议》明确，防城港市政府承担的港口行政管理职责调整由自治区北部湾港口管理局承担。根据自治区北部湾港口管理局正在修编的《广西北部湾港口总体规划》，防城港将以煤炭、矿石等大宗散货运输为主，积极发展集装箱运输，加快港区功能结构调整，提升专业化、规模化水平，逐步发展成为多功能、现代化的综合性港口，具备装卸仓储、多式联运、临港工业、现代物流、航运服务、旅游客运等功能。